Encara recentment Google Joc va aconseguir el nombre d'aplicacions amb què compta la App Store, l'oferta de apps optimitzades per a tauletes d'aquesta és encara molt superior i, en principi, això hauria de funcionar com un reclam, no només per al iPad, Sinó també per al Mini iPad davant d'altres dispositius Android. No obstant això, alguns informes especialitzats recents mostren que no totes les aplicacions funcionen correctament al nou tablet compacte d'Apple.

Un dels factors que convé tenir en compte a l'hora d'escollir una tauleta, és el vostre ecosistema. Conèixer i valorar la quantitat i qualitat de les aplicacions que podrem fer funcionar al nostre dispositiu, així com els continguts als quals tindrem accés a través d'aquest, és fonamental. Tim Cook apuntava en aquesta adreça quan a la presentació del Mini iPad va dedicar una bona quantitat de temps a destacar la amplíssima oferta de aplicacions optimitzades per al iPad que acumulava la seva App Store, davant d'una oferta principalment centrada en aplicacions per a smartphones, com seria el cas de Google Joc, i va assegurar que totes elles serien utilitzables amb el Mini iPad.
Aquest és un punt fort del Mini iPad enfront del Nexus 7, per exemple, però segons alguns informes que hem conegut recentment tindria algunes limitacions. Segons Geek.com, després de molts dies posant a prova el funcionament de la nova tauleta compacta d'Apple, han pogut comprovar que no totes les aplicacions optimitzades per iPad són realment funcionals amb l'iPad Mini. La gran majoria ho són, en qualsevol cas, cal deixar-ho clar. El problema amb el disseny d'algunes, com cal suposar, és la diferència de mida de la pantalla. Segons la pròpia guia d'Apple, les aplicacions haurien de comptar amb un espai interactiu de 44 x 44 píxels però no sembla que tots els desenvolupadors hagin seguit aquesta directriu, cosa que fa que el seu maneig pugui ser complicat. En alguns casos, la posició dels nostres dits no es reflecteix amb la precisió suficient i les nostres ordres no s'executen correctament, o no s'executen en absolut.